Wydarzenia S.T.A.L.K.E.R.: Zew Prypeci umiejscowione są w niedługim czasie po zakończeniu S.T.A.L.K.E.R.: Cień Czarnobyla. Odkrywszy ścieżkę do serca Zony, rząd postanawia zorganizować akcję militarną w wielką skalę. Operacja pod nazwą „Fairway” ma być skoncentrowana na opanowaniu CNPP i objęciu nad nim pełnej kontroli.
Zgodnie z planem operacji, pierwsza grupa ma przewodzić zwiadowcom z powietrza i nakreślić szczegółowe plany terenu i nieprawidłowości w lokalizacji interesującego ich obszaru. Następnie, robiąc użytek ze sporządzonych map, do gry wkroczy właściwa grupa wojskowych.
Pomimo gruntownego przygotowanie operacja kończy się klęską. Większość awangardowych helikopterów ulegnie zniszczeniu. W celu zbadania przyczyn niepowodzenia, Ukraińska Służba Bezpieczeństwa wysyła swoich agentów do centrum Zony. Od tej chwili wszystko leży w rękach gracza.
Kluczowe cechy gry:
- – fotorealistyczne obszary Zony – miasto Pripyat, stacja kolejowa Yanov, fabryka Jupiter, wioska Kopachi i inne, odtworzone na podstawie ich prototypów,
- – nowy scenariusz z mnóstwem unikalnych postaci.,
- – rozbudowany system misji pobocznych,
- – nowe potwory: Chimera i Burer. Nowe zachowania i zdolności wszystkich potworów,
- – całkiem nowy A-Life stworzony z wykorzystaniem ulubionych elementów graczy z dwóch pierwszych części serii,
- – do gry dodano funkcję snu,
- – zmodyfikowany interfejs gracza,
- – po ukończeniu gry istnieje możliwość jej kontynuowania w trybie freeplay,
- – Gra oparta na silniku X-Ray v.1.6.